Python – gwaslab

gwaslab

gwaslab是一个处理GWAS summary statistics数据的Python包。

  • 对summary statistics进行QC以及标准化
  • 对summary statistics进行格式转换
  • 绘制Manhattan plot, QQ plot, Miami plot, Regional plot 和Brisbane Plot等
  • 等等

GWASLab preprint: He, Y., Koido, M., Shimmori, Y., Kamatani, Y. (2023). GWASLab: a Python package for processing and visualizing GWAS summary statistics. Preprint at Jxiv, 2023-5. https://doi.org/10.51094/jxiv.370

安装方法

pip install gwaslab

使用方法

文档详见：https://cloufield.github.io/gwaslab/

Github repo ： https://github.com/Cloufield/gwaslab